茶树简化ecotilling技术的建立

ecotilling (ecotype targeting induced local lesions in genomes)可快速检测自然群体中的snp(single nucleotide polymorphism)等dna变异。第一次建立了简化的茶树ecotilling技术体系:首先筛选扩增目的基因的特异pcr引物;然后通过celi酶切pcr产物优化实验,确定酶切时间20min、10×buffer组成为250mmol/l tris-hci(ph7.4)、150mmol/lkci、15mmol/lmgso4、4lag/mlbsa和0.04%triton x-100,反应温度为47.5℃,酶量为1.8μl cje(celery juice extract)/10μl反应体系时,酶切的谱带信号较强、特异性高;初步确定合适的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测条件为凝胶浓度5%、上样量4~5μl、有效分离长度要达到15cm。利用上述简化的ecotilling对6份茶树种质870bp的ppo基因片段实现了分型,经测序验证酶切产生的谱带与6份种质内部或不同种质间的snp位置吻合。完成机构:中国农业科学院茶叶研究所茶树资源与改良研究中心/国家茶树改良中心,浙江杭州310008