连云港海通联运有限公司是在市委市政府对国有企业改制的政策召唤下，在连云港海通联运有限责任公司党委的关心指导下，在远联运总公司人员、资产、经营基础上，通过建新租旧的改革改制模式建立起来的以现代产权制度和现代企业管理制度为特征的新型企业。连云港市联运总公司组建于1984年10月，是一个以经营铁路、公路多式联运为主营项目，具有独立法人资格的全民所有制企业。原隶属连云港市交通局，在市政府机构改革实行“政企分开”后，于2002年转属连云港市海通集团有限责任公司。2004年2月27日，连云港市联运总公司八界二次职工代表大会通过了改制方案个人员安置方案。2004年3月23日，连云港海通集团批复了公司的改制方案。决定成立由海通集团控股的连云港海通联运有限公司。2004年5月21日，是工商局向连云港海通联运有限公司核发了≤企业名称预先核准通知书≥。2004年6月7日，江苏苏亚金城会计师事务所向连云港海通联运有限公司出具了≤验资报告书≥。2004年6月21日，市运输管理处向连云港海通联运有限公司核发了≤道路运输经营许可证≥。2004年6月28日，市工商局向连云港海通联运有限公司核发了≤企业法人营业执照≥。2004年7月9日，市地税局向连云港海通联运有限公司核发了≤税务登记证≥。2004年8月30日连云港海通联运有限公司第一次股东会既一届董事会、监事会召开并完成预定程序。至此，连云港海通联运有限公司设立工作基本完成，同时标志着联运总公司改革改制工作取得了成功。